FCU sistemų mokslas naudoja pagrindinius fizikos principus, ypač termodinamikos dėsnius, kurie valdo procesus, susijusius su šilumos perdavimu, pavyzdžiui, laidumu ir konvekcija. Šiluma sugeriama per jo ritę, kai aušinimo režimu šaltnešis išgaruoja ir atvės.
Kalbant apie praktines pasekmes, FCU sistemoje juda oras ir šaltnešis. Vėsinimo režimu jis paima šiltesnį orą iš šios erdvės ir pučia jį virš gyvatuko. Todėl šaltnešis pašalina šilumą iš oro ir taip jį atvėsina.
Tada šis vėsus oras vėl cirkuliuoja į patalpą, efektyviai vėsindamas. Tačiau šildymo režimu taikomas atvirkštinis procesas. Šiluma pašalinama iš šaltnešio per gyvatuką ir perduodama į orą, šildoma prieš išleidžiant atgal į patalpą.